במבצע ממוקד של כוחות צה״ל ושב״כ בפיקוד הדרום, ולאחר השלמת הליך הזיהוי, ניתן לאמת כי גופתו של מוחמד סינוואר אותרה בתוואי התת-קרקעי מתחת לבית החולים האירופאי שבחאן יונס.
סינוואר חוסל ביחד עם מפקד חטיבת רפיח, מוחמד שבאנה בפעילות משותפת של צה״ל ושב״כ ב-13 במאי 2025, בעת ששהו במתחם פיקוד ושליטה תת-קרקעי בו פועלים כעת כוחות צה״ל.
במהלך הסריקות בתוואי התת-קרקעי אותרו פריטים השייכים לסינוואר ושבאנה, יחד עם ממצאים מודיעיניים נוספים שהובאו להמשך חקירה.
במהלך הפעילות אותרו גופות מחבלים נוספות, זהותן נמצאת בבדיקה.