המטה לפיתוח מערכות מידע אחראי הן לבניית טכנולוגיות ופיתוח מערכות, והן לתורה הכלל-ארגונית לשימוש וטיפול במידע.  הטיפול במידע כולל קליטת המידע, עיבודו, ניתוח שלו ואחזורו. תפקיד המטה הוא להנחות את בעלי התפקידים בשב"כ בכל הקשור לתהליכי עבודה והשימוש במידע, להטמיע סטנדרטים וכללים לטיפול במידע, ולוודא כי מערכות המידע שמפותחות באגף מממשות כללים והנחיות אלו.